El formato de archivo MGZ es una versión comprimida del formato de archivo MGH, desarrollado por el Martinos Center for Biomedical Imaging en el Massachusetts General Hospital. Es utilizado principalmente por la suite de software FreeSurfer para el análisis y la visualización de datos de resonancia magnética (RM) estructurales y funcionales. Un archivo MGZ típicamente contiene un volumen 3D o 4D de datos de imagen cerebral, incluyendo escaneos anatómicos, superposiciones de superficie o mapas estadísticos. El formato utiliza compresión GZIP para reducir el tamaño del archivo de los grandes conjuntos de datos volumétricos, preservando toda la metainformación y la información de vóxel. Soporta varios tipos de datos, como enteros y números de punto flotante, e incluye una cabecera que almacena información sobre las dimensiones de la imagen, el tamaño del vóxel y las transformaciones de coordenadas (coordenadas RAS). Dado que es un estándar en la comunidad de neuroimagen, se utiliza a menudo para compartir datos cerebrales procesados entre investigadores y es compatible con varias cajas de herramientas y librerías especializadas en neuroimagen como NiBabel en Python. Es el formato de salida predeterminado para muchos pipelines automatizados de segmentación cerebral y reconstrucción de superficie cortical.