Le format de fichier MGZ est une version compressée du format de fichier MGH, qui a été développé par le Martinos Center for Biomedical Imaging (Centre Martinos d'Imagerie Biomédicale) du Massachusetts General Hospital (Hôpital Général du Massachusetts). Il est principalement utilisé par la suite logicielle FreeSurfer pour l'analyse et la visualisation de données d'imagerie par résonance magnétique (IRM) structurelles et fonctionnelles. Un fichier MGZ contient généralement un volume 3D ou 4D de données d'imagerie cérébrale, incluant des scans anatomiques, des superpositions de surface ou des cartes statistiques. Le format utilise la compression GZIP pour réduire la taille des fichiers des grands ensembles de données volumétriques tout en préservant toutes les métadonnées et les informations de voxel. Il prend en charge divers types de données, tels que les entiers et les nombres à virgule flottante, et inclut un en-tête qui stocke des informations sur les dimensions de l'image, la taille des voxels et les transformations de coordonnées (coordonnées RAS). Étant une norme dans la communauté de la neuroimagerie, il est souvent utilisé pour le partage de données cérébrales traitées entre chercheurs et est compatible avec plusieurs boîtes à outils (toolboxes) et bibliothèques de neuroimagerie spécialisées comme NiBabel en Python. C'est le format de sortie par défaut pour de nombreux pipelines automatisés de segmentation cérébrale et de reconstruction de surface corticale.